ポケットモンスターSPECIAL イエロー

レッドが謎の失踪を遂げた後、深い傷を負ったピカチュウがオーキド博士の研究所にたどり着く。この出会いが、ポケモンの心を理解する特別な力を持つ少女・イエローの冒険の始まりとなる。彼女はレッドを探すため、カントー地方を巡る旅に出ることを決意する。

しかし、その旅はエリートシンジケートの出現によって阻まれる。人間を排除し、ポケモンだけの世界を作ろうと企む強力な組織だ。イエローはレッドの足取りを追いながら、この恐るべき敵たちと対峙することになる。

やがて彼女は、自分の運命がカントー地方全体の未来と深く結びついていることを知るのだった。