紫色のクオリア

マリィ・ユカリは、自分以外のすべての人間をロボットとして見てしまう不気味な紫色の瞳を持つ女子高生。この特異な視覚により、他人の身体能力や特徴を機械の部品のように評価することができ、その能力は警察への協力にも活かされている。しかし、その才能ゆえに社会的に孤立し、彼女を受け入れ守ってくれる唯一の友人・鳩生まなぶ（ガク）だけが心の支えだった。

ユカリの人生は、その特異な能力を見込まれ秘密組織に勧誘されたことで一変する。この出来事をきっかけに、ガクは非合法な実験、量子物理学、そして並行世界が絡み合う危険な世界へと巻き込まれていく。

ガクは自らの機転とユカリへの深い想いだけを頼りに、謎と科学の迷宮を進みながら、陰で迫る脅威から友人を守ろうと奔走する。