名探偵コナン　銀翼の奇術師

怪盗キッドが、東京発函館行きベルツリー航空884便に搭載された宝石の強奪を予告する。その機内には、舞台観劇のため函館へ招待された江戸川コナン、毛利蘭、毛利小五郎の姿があった。しかし、フライトはいつしか怪盗と若き探偵による危険な頭脳戦の舞台へと変わっていく。

キッドが計画を進める中、機内で不可解な殺人事件が発生し、コナンは乗客たちの捜査を余儀なくされる。さらに航空機は予期せぬ事態に巻き込まれ、乗客乗員全員の命が危険にさらされる。刻一刻と迫るタイムリミットの中、コナンは犯人を暴き、未曾有の大惨事を防がなければならない。一方キッドは、変幻自在のマジックと偽りで、なおも翻弄し続ける。