魔法科高校の劣等生 孤立編

司波達也とその妹・深雪は、現代魔法が高度な技術へと発展したエリート校、国立魔法大学付属第一高校の生徒である。魔法力が低く「劣等生」と見なされる達也だが、実際には類まれな能力を持つ強力な魔法師だった。一方、深雪は校内でも屈指の才能を持つ魔法師の一人である。

前章での出来事を経て、達也と仲間たちは、彼らの忠誠心と力を試す新たな脅威に直面する。謎の組織が影で動き始め、魔法世界のパワーバランスを揺るがそうとしていた。達也は、自らの知略と力を尽くして大切な人々を守りながら、これらの攻撃の背後に隠された暗い秘密を暴いていくことになる。