涼宮ハルヒの驚愕

SOS団に新たな一年生が入団するが、彼女は見た目以上の存在である可能性がすぐに浮上する。彼女の到来は、それまで分離していた二つの異なる現実が収束する時期と重なり、新たな連続する怪事件を引き起こす。

ハルヒを取り巻く超常現象に慣れっこになっている団員たちは、複雑なジレンマに直面する。新入団員は二つの時間軸を結びつけ、現実を安定させる鍵となりうる特異な能力を持っているように見えるが、彼女の真の意図は謎に包まれている。