ポケットモンスターSPECIAL ブラック２ ・ ホワイト２

ブラックは、壊滅したプラズマ団の残党を追う国際警察の捜査官。一方、元プラズマ団のメンバーだったホワイトは、過去を隠し、アサティアシティで目立たず静かに暮らそうとしていた。

だが、プラズマ団の残党が影で再び動き始めたことで、ブラックの追跡とホワイトの「過去を捨てたい」という願いは交差する。二人は新たな争いに巻き込まれ、自らの信念を試され、過去の亡霊と向き合うことを余儀なくされる。