結城友奈は勇者である

結城友奈は中学二年生で、一見平凡な毎日を送っている。彼女は友人たちと共に「勇者部」に所属し、善行を行い、周囲の人々を笑顔にするための活動に励んでいた。日常の活動は、困っている人を助けたり、子どもたちのために発表会を開いたりすることだ。

しかし、その穏やかな日々は、バーテックスと呼ばれる謎の破壊的存在が世界を脅かし始めたことで一変する。スマートフォンの奇妙なアプリを通じて、勇者部はこの脅威に立ち向かうよう召喚される。親友の東郷美森や、犬吠埼姉妹の風と樹を含む部員たちは、自らが魔法少女に変身してバーテックスと戦えることを知る。

学業や部活動と、この新たな危険な使命との両立に苦心しながら、少女たちは自らの力が秘める過酷な現実に直面することになる。その過程で、彼女たちは「勇者」であることの本当の意味を問い、見つめ直すことを余儀なくされていく。