上野さんは不器用

上野は中学3年生で科学部の部長を務める、天才的な発明家である。彼女は密かに、同学部に所属する2年生の田中に恋心を抱いている。しかし、その優れた知性は恋愛面には及ばず、自分の気持ちを表現するのがまったく不器用だった。

この問題を解決するため、上野は自身の風変わりで、しばしば大掛かりな発明品を駆使することにした。各話で新しい装置が登場し、彼女はそれを用いて間接的に、そして毎回失敗しながらも田中に近づこうとしたり、ロマンチックな状況を生み出そうと試みる。創意工夫に溢れつつも繊細さに欠ける彼女の計画は、決して思い通りにはならず、滑稽で気まずい出来事の連続を引き起こしていく。