とある科学の超電磁砲SS　蛇足、またはとある事件の終息

学園都市。そこは、学生たちが超能力を開花させる巨大な都市。その中でも第三位の実力を持つ『超電磁砲』御坂美琴は、親友である白井黒子、初春飾利、佐天涙子とともに、授業や風紀委員の活動に追われながらも、友情と能力が試される日常の小さな事件に立ち向かっていた。

しかし、学園都市の静かな学区で相次ぐ窃盗事件と騒動が、彼女たちの平穏を揺るがす。美琴と仲間たちは調査に巻き込まれ、やがて学園都市の微妙な力の均衡を脅かす陰謀の存在にたどり着く。

持ち前の機転と電撃を武器に、『超電磁砲』は手遅れになる前に謎を解き明かし、周囲の人々を守るため奔走する。