マブラヴ オルタネイティヴ トータル・イクリプス Prayer of Phantom

2001年、複数の戦術機パイロットが訓練シミュレーター内で謎のF-4ファントムの出現を報告する。この幻の戦闘機は稼働中のあらゆるシミュレーションに強制的に割り込み、システムからは探知されず、シミュレーターがロックされているにもかかわらず、立ち向かうすべての人間パイロットを例外なく撃破する。

ヴィンセント・ローウェルからこの現象の話を聞き、好奇心から現場を訪れたパイロット、ユウヤ・ブリッジスは、同じ基地にいたメイ少尉と共闘を余儀なくされる。二人はこの幽霊のような脅威の正体を調査し、無敵のF-4ファントムの背後に隠されたものを突き止めなければならない。