マジカルパティシエ小咲ちゃん!!

小野寺小咲は、家業の和菓子店を手伝う穏やかな日々を送っていた。しかし、ある日を境に彼女と千棘、万里花の三人は、世界の平和を守る魔法少女の力を授かる。小咲はトリオのリーダーを任され、以来三人は街に混乱をもたらす巨大な怪物たちに立ち向かうことになる。

巨大な手下を倒した後、三人はその怪物たちを生み出している黒幕の存在に気づく。その張本人こそ、かなり風変わりな趣味を持つ歪んだ頭脳の持ち主、舞子博士だった。一方、小咲の家の店は人手不足に悩まされており、楽が手伝いに来ることになるが、それが小春の不興を買ってしまう。

魔法バトル、コメディ、そしてちょっと際どいシチュエーションが織り交ざる中、小咲はヒロインとしての務めと、和菓子店の日常を両立させようと奮闘する。