鋼鉄天使くるみ

大正時代、見習い神官の神楽中人（かぐら なかひと）は、科学者・綾小路博士の秘密研究所を発見する。そこで出会ったのは、高度な軍事戦闘用に設計された鋼鉄の天使・くるみだった。帝国軍の攻撃が施設を揺るがす中、二人の唇は偶然重なり、その口づけによってくるみは目覚め、中人を唯一の主人と認める。

以来、帝国軍に追われる身となった中人とくるみ、そして綾小路博士は、命からがら逃亡を続ける。さらに、くるみの“姉妹”であるサキとカリンカが起動し、事態はより危険な様相を呈していく。

逃避行のさなか、三人は鋼鉄の天使たちの力の源である「エンジェルハート」の真実を探ろうとする。しかし行く手には、くるみを破壊するために起動された他の天使たちが立ちはだかるのだった。