フルメタル・パニック！ 0 ‐ZERO‐

ミスリルという秘密軍事組織に所属する若き兵士、相良宗介は、特殊な能力を持つ女子高生、千鳥かなめを護衛する任務を負う。しかし今回、彼が直面するのはこれまでとは異なる脅威だった。高度なテクノロジーを駆使して現実そのものを操作し、宗介たちの限界を試す敵の存在である。

世界的な紛争が進行する中、宗介とかなめは、強力な勢力と、自分たちの最も深い秘密を知る謎の敵が絡む陰謀に巻き込まれていく。現実と幻覚の境界線は次第に曖昧になり、二人はこれまで信じてきたすべてを疑わざるを得なくなる。