エヴァンゲリオン ANIMA

第三次衝撃を防いでから3年後、別の可能性の世界では地球に平和が訪れていた。NERVは葛城ミサトの指揮のもと再編され、碇シンジは惣流・アスカ・ラングレーと綾波レイの助けを借りてEVAチームを率いている。技術は進歩し、エヴァンゲリオン各機は強化され、3機の零号機タイプが地球を監視するために軌道上を周回していた。

NERVがシンジの初号機F型を更新しようとした矢先、軌道上の零号機タイプの1機が制御を失い、第3新東京市の近郊に墜落する。その直後、NERVは謎の使徒担体、奇妙に改造された量産型エヴァンゲリオンによる攻撃を受ける。シンジ、アスカ、レイは攻撃を食い止め、新たな敵の正体を突き止めなければならない。