映画妖怪ウォッチ 誕生の秘密だニャン!

ある夜、ケータの妖怪ウォッチが時空のパラドックスの影響で突然消えてしまう。取り戻すため、ケータ、ジバニャン、ウィスパーはフユニャンとナサニエルの力を借りて、60年前の過去へと旅立つ。

過去の世界で、彼らは妖怪ウォッチ誕生の秘密を知ることになる。しかし、新たな困難が次々と立ちはだかり、三人の友情が試される。パラドックスを解決するため、歴史を変えずに元の時代へ戻る方法を探さなければならない。