メルティブラッド X

タタリの事件の後、弓塚さつき、シオン・エルトナム・アトラシア、リーズバイフェ・ストリンドベリは、社会からはじき出された者たちとして路地裏に身を隠しながら生きていた。吸血鬼であるさつきとシオン、そしてリーズバイフェは、目的もなくただ存在を続けている。そんな不安定な暮らしをどうにかしようと、シオンは錬金術の力を使って、三人がまともに住める家を建てようと決意する。

ところが実験はひどく失敗し、家の代わりに高さ百メートルのピラミッドが街の真ん中に出現してしまう。この出来事の裏にもっと邪悪な何かが潜んでいると疑った三人は、謎の構造物の中へと足を踏み入れ、調査し、事態を収拾しようと試みる。