ゴジラvsスペースゴジラ

1989年の悲劇から数年が経った。復讐の念に駆られた男、結城晶は、かつて混乱と破壊をもたらした放射能怪獣ゴジラとの対決を計画していた。しかし、怪獣王を狙うのは彼だけではなかった。宇宙の彼方から、新たな恐怖が迫っていた。ゴジラだけでなく、人類全体にその目を向けた銀河の暴君、スペースゴジラである。

結城が個人的な攻撃の準備を進める一方、世界中の軍事・科学組織は、二大怪獣を止める術を必死に模索していた。だが、スペースゴジラが地球に降り立つと、既知のすべてを超える破壊力が解き放たれ、戦況は激化する。

二体のゴジラが激突する。地球の運命を懸けた戦いの行方は。生き残り、真の怪獣王の座を手にするのはどちらなのか。