特務咆哮艦ユミハリ

日本は時間戦争によって壊滅的な被害を受けていた。少年ショウイチは二人の妹や他の子供たちと共に、船で国外への脱出を図る。しかし航海中、未来から来た異様な侍たちに襲撃される。混乱の中、シズエという少女が未知の生命体に顔を奪われてしまう。

子供たちは謎の戦艦「ユミハリ」の乗組員に救助される。艦内でショウイチは、シズエの顔が完全に治癒していることに気づく。この出来事をきっかけに、襲撃者たちの正体や、この艦の真の目的をめぐる数々の疑問が浮かび上がっていく。