すべてがFになる

犀川教授と教え子の西之園萌絵は、孤島に建つ、謎めいた真賀田四季博士の密室研究所を訪れる。真賀田の両親殺害事件の真相に興味を持った二人は、なんとか施設への立ち入りを果たす。滞在中、ドレスを着た遺体が真賀田の部屋から投げ出され、彼女が殺害されたことを示唆する。

この出来事をきっかけに、犀川と萌絵の知性が試される一連の謎が幕を開ける。事件の真相を追ううちに、二人は閉塞感の漂う環境と、欺瞞と暴力に満ちた暗い網の目を暴きかねない秘密に直面していく。