超劇場版　ケロロ軍曹２　深海のプリンセスであります！

休暇中、夏美のもとを海から現れた二人の異星人が訪れる。一人は女性、もう一人は男性で、夏美はその男性にほのかな想いを抱き始める。この出会いをきっかけに、夏美は深海のプリンセスとなってしまう。ケロロ小隊の仲間たちとともに、夏美は謎の海洋生物が引き起こす数々の危険に立ち向かわなければならなくなる。

異星人の姫の正体と、海を脅かす存在の目的がやがて明らかになるにつれ、主人公たちの運命は複雑に絡み合っていく。ケロロ小隊は、アクションと危険に満ちた海底での冒険に乗り出す。夏美を守り、深海に隠された真実を解き明かそうとする中で、コメディと緊迫したドラマが交錯していく。