早苗さんは家出中!

守矢神社の巫女、東風谷早苗は家出を決意し、東京へと移り住む。幻想郷での務めから離れ、慣れない都会の日常生活に戸惑いながらも、孤独と向き合い新たな環境に適応しようと努める。

自分の居場所を探す中で、早苗は東京で平凡な生活を送る東方Projectの様々な人物たちと出会う。出会いとすれ違いを重ねるうちに、彼女はこの家出が本当に自分に必要なことなのか、それとも本当の居場所は意外なところにあるのかを見つめ直していく。