ゾイド・フューザース

R.D.は、ゾイドバトルチームでもある企業マッハストームで配達員として働いている。彼の目標は、父親から聞かされ、その存在を固く信じている伝説の機械生命体アルファゾイドを見つけるために資金を貯めることだ。

コロシアムでの初バトルで、R.D.はゾイド同士が融合するという特殊能力を持つライバルチームと対戦する。驚いたことに、自分のゾイドであるライガーゼロもこの技術に対応していることが判明する。この予期せぬ発見をきっかけに、アルファゾイドの探索と融合可能なゾイドの謎が絡み合う新たな冒険が始まる。