とある科学の一方通行【アクセラレータ】

科学の最先端をいく学園都市には、六段階に分けられた数百万もの能力者たちが暮らしている。レベル5に到達したのはわずか7人。その中で最強とされるのが一方通行（アクセラレータ）だ。無邪気な打ち止め（ラストオーダー）を守るためにその力の大部分を失った彼は、かつて恐れられた能力者としての面影を残しつつも、今は病院で比較的穏やかな日々を送っている。

しかし、学園都市の暗部は決して眠らない。打ち止めの写真を手にした謎の少女、エステル＝ローゼンタールを救ったことをきっかけに、一方通行は新たな争いに巻き込まれる。対魔術式駆動鎧（アンチスキル）に潜伏する不穏な組織「処罰（ディシプリナリーアクション）」が、危険な任務のために打ち止めを利用しようとしていたのだ。

世界最強の能力者と新たな仲間は、少女を守り、学園都市を守るために立ち上がる。