終末トレインどこへいく？

謎の7Gネットワークの起動によって世界は一変し、日本は混乱に陥った。阿賀野市は数少ない居住可能な場所の一つだが、21歳以上の住民は動物の姿に変わってしまっている。この奇妙な新秩序の中、女子高生の千倉静留は、行方不明になった友人・中富葉香を必死に探していた。

葉香が池袋にいるという手がかりを見つけた静留は、旅に出ることを決意する。公共交通機関は機能しておらず、彼女に残された唯一の手段は、年老いた運転士から操縦を教わった放置された列車だった。出発の日、クラスメイトの撫子、玲実、晶が合流する。四人の少女たちは、道中に待ち受ける危険も、終点で何を見つけるのかも知らないまま、未知の世界へと踏み出していく。