頭文字[イニシャル]D THIRD STAGE

高校を卒業したばかりの若き走り屋、藤原拓海は、エンペラーのリーダーである須藤京一との対戦中にAE86のエンジンブローという形で手痛い敗北を喫する。自分の実力に疑心暗鬼となった拓海のもとに、レッドサンズのリーダー・高橋涼介から意外な誘いが届く。プロのレーシングチームに加わらないかというのだ。拓海はその申し出を受けるべきか、それとも自分の道を進むべきか、思い悩む。

決断を下す前に、拓海はリベンジを果たすべく須藤京一への再戦を申し込む。さらに、父・文太の宿敵を父に持つ二代目レーサー、カイ・コガシワとも対峙することになる。新たな戦いのプレッシャーと自らの将来への不確かさのなかで、拓海は自分の信念を見つめ直し、プロの世界へ飛び込むだけの器が本当に自分にあるのかを確かめていく。