劇場版 イナズマイレブンGO vs ダンボール戦機W

伝説のイナズマレジェンドジャパンと新生イナズマイレブンによるエキシビションマッチの最中、突如としてスタジアムが、この世界では未知の技術である小型ロボット・LBXの謎の軍団に襲撃される。天馬たちは応戦するものの、ロボットは次々と現れるばかり。混乱のさなか、山野バンが彼らを救うために姿を現す。

今、最強のサッカーチームと最強のLBX軍団が手を組み、共通の脅威に立ち向かう。一方で、イナズマイレブンGOとダンボール戦機Wの世界は衝突し、全員が未知の次元へと飲み込まれていく。両者は協力し、自分たちの現実に何が起きたのか、そしてこの襲撃の黒幕は誰なのかを突き止めなければならない。