青春ブタ野郎はロジカルウィッチの夢を見ない

梓川咲太は、友人の古賀朋絵と共に時間のループを乗り越え、もはや大抵のことでは驚かないと思っていた。しかし、その常識は脆くも崩れ去る。ある夜、咲太はクラスメイトで友人の双葉理央がネットカフェにいるのを目撃する。しかも、彼女は電話で「自分自身」と話していた。突如として、まったく同じ姿をした二人の双葉理央が存在するという、不可解な現象が起きる。二人はこれを、謎に包まれた「思春期症候群」の仕業だと考えていた。

一人の理央が咲太の家に身を寄せることになり、咲太はこのドッペルゲンガーの謎を追うことになる。しかし、論理的な彼女たちはどちらも、明確な説明をしようとしない。そして時間は迫っていた。もし二人が出会ってしまったら、何が起きるのか誰にもわからないのだ。