冥界の超越者、アカデミーへ帰還する

魔王を倒し世界を救った大魔導士レオン・クラインは、王子シャルクの裏切りに遭う。レオンが大切にしていた孤児院を焼き払った上で、彼は暗黒の深淵へと突き落とされた。十年もの間そこに囚われたレオンは、復讐の念を糧に無数の魔物を屠り続け、その過程で未知の呪文を数多く身につけていった。

ついに地獄からの脱出を果たしたレオンが目を覚ますと、そこは名門・聖桜学園。彼はそこでいじめを受けている生徒、黒羽レンの体に宿っていた。新しい自分に戸惑いながらも学園生活に適応しようとする中、レオンはあのシャルクもまた学園に潜み、陰で邪悪な計画を進めていることを知る。

顔は変わっても正義への意志は変わらない。レオンは学園生活と、かつての戦いの続きとの間で、自らの運命を切り開いていく。