神と呼ばれたオタク

遠い未来。国立航空宇宙アカデミーに所属するオタクのススムは、支援AIミネルヴァと共に宇宙船ナグルファル号で卒業試験に臨んでいた。試験を終えた彼は、大好きな『魔法少女プリティキュア』の劇場版を見ることを楽しみに、コールドスリープへと就く。

しかし目を覚ますと、地球は荒廃し、人類は姿を消していた。オタクの心を持つこの青年は、荒れ果てた世界の数々の困難に立ち向かい、人類を蘇らせる術を探し求めていく。