陰キャの俺が席替えでS級美少女に囲まれたら秘密の関係が始まった

陰キャオタクの泉谷涼太は、席替えをきっかけに平穏だった学校生活が一変する。クラスで一番人気の美少女三人に囲まれることになったのだ。前に座るのは、甘えん坊で妹系の美山愛莉。左隣は、クールで距離を置くギャルの一ノ瀬優里亜。右隣は、上品で真面目な学級委員の黒木瑠璃。

ところが涼太は、ひょんなことから彼女たちそれぞれが決して人に言えない秘密を抱えていることを知ってしまう。秘密を知られた三人から、それがバレたら平穏な日常が終わると迫られ、涼太は彼女たちと秘密の関係を続けることを余儀なくされる。

目立たず静かに過ごしたいだけだった涼太だが、三人の問題児で魅力的なクラスメイトに振り回されながら、この厄介な状況をどうにか乗り切ろうと奮闘する。