ヤンキー君な山田くんとメガネちゃんと魔女

物語の中心にいるのは、学校で不良として名高い山田と、いつも眼鏡をかけた謎めいた少女。ある日、二人は偶然に出会い、その瞬間から平凡だった学園生活が一変する。教室や廊下、通学路といった見慣れた風景の中に、説明のつかない奇妙な現象が次々と現れ始める。

最初は戸惑いながらも、二人は次第にその状況へ巻き込まれていく。衝突したり助け合ったりするうちに、彼らの間にはコミカルで、どこかロマンチックな空気が生まれていく。日常と魔法の境界線は少しずつ曖昧になり、何が現実で何が幻想なのか、彼ら自身にもわからなくなっていく。

やがて、二人の間に築かれた特異な絆が、彼らの行動によって引き起こされた予期せぬ結果に立ち向かうための、唯一の鍵となる。