宇宙のステルヴィア

西暦2356年、人類はヒドルスβ星の超新星爆発による大災害から未だ立ち直れずにいた。地球人口の大半が失われ、第二波の破壊に備え、また宇宙活動を監視するために「ファウンデーション」と呼ばれる巨大な軌道ステーションが建設されている。カタセ・シマは、自分の目で宇宙を見たいという夢を抱く少女であり、母の反対を押し切って地球近郊に位置するステルヴィア学園に入学する。

ステルヴィアでシマはパイロットを目指して訓練に励み、迫り来る脅威から地球を守るための重要計画「グランドミッション」のメンバーに選ばれることを切望する。厳しい授業に食らいつきながら、複雑な人間関係にもまれつつ、彼女は人類を守る力が自分にあるのかを見極める成長の旅を始める。