月は東に日は西に〜Operation Sanctuary〜

久住直樹は高校生。五年前の事故で両親を失い、現在は叔母夫婦と従姉妹の祭と暮らしている。日常生活は平穏そのものだが、ひとつだけ気がかりなことがあった。幼い頃の記憶がまったく思い出せないのだ。ある晴れた日、公園のベンチで休んでいると、美琴という名の赤い髪の少女が文字通り空から降ってきて、直樹の上に落ちてくる。驚いたことに、彼女は直樹が自分の弟だと言い張るのだった。

直樹の時代は未来から来た人々の一時的な避難所として機能しており、未来では多くの人が不治の病に苦しんでいた。弟の勇介が過去へ送られたことを知った美琴は、彼を探すために時を越えてやってきたのだ。美琴の出現をきっかけに、直樹は自分の記憶の空白と向き合い、この謎めいた来訪者とのつながりの真実を明らかにすることを余儀なくされていく。