トモちゃんは女の子！

相沢智は、幼い頃から隣人で稽古仲間の久保田淳一郎と大の仲良し。スポーツ万能で元気いっぱいの智は、ずっと淳に恋をしているが、彼は智をまるで弟のように扱い、女の子として見てくれない。高校入学を機に、智は自分の気持ちを伝えようと決意する。しかし、持ち前のまっすぐな性格と、何でも拳で解決しようとする癖が災いして、淳の目には相変わらず「男友達」のまま映ってしまう。

智は、自分らしさを失わずに、どうにかして淳に「女の子」として意識してもらおうと奮闘する。すれ違いやドタバタ劇、仲間たちの助けを借りながら、淳自身が無意識に築いてしまった壁を壊そうと試みる日々。果たして智は、目の前にいる自分の魅力に淳を気づかせることができるのか。