ストライクウィッチーズ 劇場版 501部隊発進しますっ!

宮藤芳佳は、戦争での経験を経て、故郷の村で穏やかな日々を送っていた。しかし、かつての上官・坂本美緒が、ヨーロッパの医学校への留学制度を芳佳のために用意していた。芳佳は、坂本の海軍学校での教え子だった服部静夏と共に、再び大陸へと旅立つ。

ヨーロッパへと進む芳佳と静夏の前に、謎の航空敵性体「ネウロイ」の新たな活動の兆候が現れ始める。この脅威を前に、各地に散っていたかつての第501統合戦闘航空団のメンバーたちが再び集結を始める。そして、芳佳たちの眼前に、強力で未知なるネウロイが直接姿を現したことで、その再集結は急を要するものとなる。