新宝島

若きウサギのジム・ホーキンズは、宝の地図を見つけたことをきっかけに、胸躍る冒険の旅へと乗り出す。動物たちで構成された乗組員とともに、彼は伝説の海賊フリントが残した財宝を求めて、遠く離れた孤島へと船を進める。船員の中には、片目のオオカミで、真の狙いを隠した恐ろしいシルバーの姿もあった。

やがてジムは、シルバーとその手下たちが財宝を独占するために反乱を企てていることを知る。若いウサギは、数少ない忠実な船員たちと手を結び、海賊たちに立ち向かい、島で生き延びなければならなくなる。宝探しは、やがて生き残りを懸けた戦いへと変わり、彼の唯一の武器は機転と勇気だけとなる。