新海底軍艦

広島に原爆が投下された直後、秘密裏に建造された日本の潜水艦がアメリカの潜水艦と交戦し、ともに歴史の闇へと消えていった。それから五十年後、南極で発生した異常現象を調査するため派遣された国連の特殊部隊は、謎の黒い円柱によって脅威にさらされる。

調査の結果、その円柱は人類への復讐を企てる古代海底帝国の一部であることが判明する。彼らを阻止するためには、伝説の日本の潜水艦「新海底軍艦」と、その謎めいた艦長を見つけ出さなければならない。