セイバーマリオネットJ to X

前作から数か月後、小樽はライム、チェリー、ブラッドベリーという自身のマリオネットたちと共に日々を過ごしていた。奉仕と護衛のために設計された彼女たちは、やがて主人に対して人間らしい感情を抱くようになり、忠誠と愛情に満ちた家族のような絆を築いている。

しかし、悪しきファウストが再び現れ、禁断のマリオネット技術を用いた実験を再開したことで平穏は脅かされる。ファウストはセイバードールズを再起動させる。彼女たちは強力でありながらも、ファウストへのプログラムされた忠誠と、小樽に対して芽生え始めた惹かれる想いとの間で葛藤するアンドロイドたちだった。

小樽とマリオネットたちは、かつての敵であり新たな敵でもある彼女たちの複雑な感情や忠誠心と向き合いながら、この新たな脅威に立ち向かわなければならない。