ピカチュウたんけんたい

野原で静かに昼寝をしていたトゲピーが目を覚まし、飛び回るポケモンたちに気を取られているうちに、仲間からはぐれてしまう。トゲピーの不在に気づいたピカチュウ、フシギダネ、ゼニガメ、コンパン、マリル、コダックは、トゲピーを見つけるため救助の旅に出る。

探索の途中、一行はエレキッドと出会い、タマタマの群れのもとへ案内される。そのうちの一匹が卵を一つ失くしており、トゲピーを自分の抜けた部分と勘違いしたことで、事態はさらにややこしくなる。やがて近づく嵐がトゲピーとタマタマたちを押し流そうとし、ピカチュウたちはチームワークと決意を試されることになる。