Meitantei Conan: Internet Nazo no Mail Jiken

江戸川コナンと少年探偵団のメンバーは、学校の調べ学習を進めるため図書館に集まっていた。作業に取り組んでいると、突然彼らのもとに一通の謎のメールが届く。差出人不明のそのメッセージには、次に向かうべき場所を示す手がかりが隠されていた。

メールの指示に導かれ、コナンたちはデジタル上の情報と現実の世界を行き来しながら、街のさまざまな場所を巡る探索を開始する。暗号を解き、新たなメールを受け取り、時に迷いながらも、若き探偵たちはそれぞれの知識と発想力を出し合って前に進んでいく。

謎を解く鍵は、メンバー全員の協力と柔軟な発想にある。デジタルと現実が交差する中で、彼らは最後の手がかりへとたどり着くことができるのか。