メガゾーン23 PART II 秘密く・だ・さ・い

前作の出来事の後、矢作省吾はバイク仲間や恋人・由衣とともに平穏な日常を取り戻そうとしていた。しかし、メガゾーン23の平和は脆い。謎のデザルグが新たな恐るべき兵器を携えて再び現れ、円筒都市の防衛が試される。

軍がこの外部の脅威に立ち向かう一方で、内部の対立も激化する。完全な支配に執着するB.D.は、都市の中枢システムであるEVEの最終防護レベルをいまだ突破しようとしていた。EVEが省吾に助けを求めたとき、彼は可変バイク・ガーランドの在り処を知り、再び争いの中心へと引き戻される。最終決戦が多方面で迫る。