めだかボックス アブノーマル

雲仙冥利との戦いを終え、箱庭学園には束の間の平和が戻った。しかし、それも長くは続かない。黒神めだか率いる生徒会は、学園長が「フラスコ計画」と呼ばれる不穏な計画を進めていることを知る。さらに、傲慢で圧倒的な力を持つ都城王土をリーダーとする、新たな天才集団「十三組」が姿を現した。

人間以上の存在であることを明かしためだかは、そのすべての能力と人脈を駆使して、これらの脅威に立ち向かわなければならない。彼女は「戦神モード」と仲間たちの助けを借りて、自らの驚異的な力をもってしても試されることになる暗い秘密に挑んでいく。