甲鉄城のカバネリ

産業革命の時代、謎の疫病が人間を「カバネ」と呼ばれる攻撃的で不死の怪物へと変えていた。カバネを倒すには、鉄の皮膜に守られた心臓を破壊するしかない。ヒノモト島では、人々は要塞化された駅に身を寄せ、装甲蒸気機関車「駿城」で駅同士を行き来しながら生き延びていた。

顕金駅で駿城の整備士として働く若き技術者・生駒は、カバネの心臓を貫ける秘密兵器を密かに開発していた。そんな折、制御を失った駿城が駅に衝突し、カバネの群れが雪崩れ込む。混乱の中、生駒はカバネの検査を免除されているらしい謎の少女・無名と出会い、二人は生き延びるために共に戦うことになる。