神のみぞ知るセカイ: Flag 0

地獄の spirit hunter であるエルシィは、上司である対策室長ドクロウ・スカルから重大な任務を受ける。それは、地獄の牢獄から脱走した悪霊たちを捕獲するため、地上へ赴くというものだった。悪霊たちが人間に害を及ぼすのを防がなければならない。

しかし、任務は容易ではない。悪霊たちは人間の心の隙間に入り込み、感情の空白を利用して潜んでいるからだ。エルシィは地上での生活に適応しながら、宿主である人間を危険にさらすことなく悪霊を追い出す方法を見つけなければならない。まったく未知の世界で、思いがけない事態に直面することになる。