大図書館の羊飼い

筧京太郎は、国立国会図書館に匹敵する巨大な図書館を誇る名門校・汐美学園の二年生である。図書部に所属する彼は、いつものように大図書館で一人読書にふける日々を送っていた。そんなある日、「努力する学生の願いを叶える」と噂される都市伝説の存在「羊飼い」を名乗る人物から、一通の不思議なメールが届く。

そのメールは彼の運命を変える出来事を予告しており、京太郎は近くの駅へと走る。そこで彼は、脱線した電車に轢かれそうになった二年生の白崎つぐみを救う。感謝したつぐみは図書部に入部し、京太郎を自らの謎めいた「汐美ハッピープロジェクト」へと誘う。こうして新たな部員たちと共に、学園をより良くするための活動と、謎に包まれた羊飼いの正体を探る日々が始まる。