コスモウォーリアー零

地球と機械人間との長きにわたる戦争は終結したが、その和平はむしろ機械人間側の勝利に近いものだった。戦争中に家族を機械人間に奪われたウォリアス・ゼロは、今やかつての敵との協力を余儀なくされた地球艦隊に身を置いている。

人間と機械人間の混成クルーを乗せた艦の指揮を任されたゼロに、ほとんど不可能な任務が下る。宇宙海賊キャプテン・ハーロックの捕縛だ。命令を遂行しようと奮闘する中で、両陣営の間の脆い平和が、見かけほど堅固なものではない兆候が浮かび上がり始める。