超ロボット生命体トランスフォーマー マイクロン伝説

機械惑星セイバートロンでは、変形能力を持つロボット生命体トランスフォーマーたちが、果てしない戦いを繰り広げていた。オプティマスプライム率いるサイバトロン軍と、宿敵デストロン軍は、戦局を決定づける新たな力、特殊能力を持つ小型トランスフォーマー「マイクロン」の獲得を狙っていた。戦火の拡大を避けるため、マイクロンたちは宇宙の彼方へと逃亡する。

それから400万年後、地球では3人の子供たちが洞窟で偶然謎のパネルを作動させる。この出来事により、休眠状態にあったマイクロンたちが目覚める。彼らの再出現は、人類の星でかつての戦争を再燃させ、サイバトロンとデストロンの両軍がそれぞれの大義のためにマイクロンの力を手に入れようと地球に集結する。