ある少年の口の中に、歯の間に残った食べかすを分解することに専念する細菌の一群が住んでいる。彼らの日常は、糖分を摂取して増殖し、やがて歯のエナメル質を少しずつ傷つけていくコロニーを形成することにある。その中でも、歯越しに外の世界を観察する好奇心旺盛な小さな細菌が目を引く。
少年がキャンディを口にすると、細菌たちは成長を加速させる饗宴を繰り広げる。しかし、歯磨きは彼らの存在を脅かす絶え間ない脅威となる。小さな細菌は、毎回の食事と毎回の清掃がゲームのルールを変える過酷な環境で、生き残りをかけた戦いに挑まなければならない。