武装錬金

武藤カズキは高校生。ある夜、謎の少女を怪物の襲撃から救おうとして命を落とす。自室で目を覚ました彼はすべてを夢だと思うが、蛇のような怪物が妹と自分を襲ったことで、それが現実だと知る。少女・津村斗貴子は、あの怪物はホムンクルスであり、ヨーロッパの錬金術師が生み出した人間を喰らう存在だと説明する。カズキを救うため、斗貴子は彼の胸に人工の心臓として機能する錬金術のメダリオン「核鉄」を埋め込んでいた。

核鉄は持ち主に応じて唯一の形態に活性化し、ホムンクルスを破壊できる唯一の武器「武装錬金」を生み出す。カズキは自らの武装錬金、巨大な槍「サンライト・ハート」を発現させ、斗貴子は処刑用の鎌「ヴァルキリー・スカート」を振るう。二人はホムンクルスとその謎の首謀者に立ち向かいながら、カズキは大切な人々を守り、戦いの日々に適応しようとする。