A.I.C.O. -Incarnation-

2035年、日本の研究施設で「バースト」と呼ばれる事故が発生し、「マター」という人工生命体が生み出された。マターは触れるものすべてを侵食しながら黒部峡谷一帯に広がり、ダムや軍事施設の廃墟を包み込んでいく。特殊部隊が封じ込めを試みる一方、傭兵たちはその存在の真相を追い求めていた。

それから2年後、事故で家族を失った15歳の少女、橘アイコは常に医療監視下で暮らしていた。彼女の日常は、転校生の神崎雄哉が現れたことで一変する。ユウヤはアイコに、彼女の体にある秘密が隠されていると告げる。そして、バーストを止める鍵は災害の中心地である「プライマリーポイント」にあり、そこに到達できるのはアイコだけだと言う。

ユウヤと仲間たちと共に、アイコはマターが蔓延る峡谷の奥地へと危険な旅に出る。陰謀、そして水のように流動する敵に立ち向かいながら、彼女は自らの存在に隠された真実を、手遅れになる前に解き明かさなければならない。